大豆主根和侧根上生长有许多根瘤，主要生长在20厘米以内土壤耕层内，30厘米以下很少。其大小一般直径在4～5毫米，个别也有1厘米左右的，大豆出苗3天用放大镜就可看到根瘤，4～6天，肉眼可以看到，结荚至籽粒鼓粒至1/3大小时根瘤数量、固氮量达到高峰，此后开始衰退。

根瘤菌具有固氮能力。据测定，每亩可积累氮素3～3.5公斤，相当于17.5公斤硫酸铵。根瘤菌固定的氮可供大豆一生需要量的二分之一到四分之三。因此，一方面大豆可节省大量氮肥，另一方面单靠根瘤菌固氮并不能满足大豆生长发育的需要，还必须根据地力施底肥和追肥。

影响根瘤形成及固氮功能的因素很多，主要因素有大豆品种、矿质元素、水分含量、氮、光照、PH值和温度等。不同品种大豆根瘤形成时间、大小及固氮量有所不同。土壤施氮肥过多影响根瘤形成及固氮，施磷肥可增加固氮量，缺钼、铁、钴等微量元素影响固氮。土壤水分过多过少对根瘤固氮都不利。适宜的氧气，充足的光照有利于固氮。中性及微碱性土壤，PH值在6.8～8.8范围内利于根瘤菌的生长及固氮。

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